Q_Seq: PerlScript 711 a.a. Protein
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s_m = 2218 s_ss = 4 s_cc = 126 go = -900 ge = -340
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H:p:L:
:A t: bb:8:P:(::0::::@:X::X::@: LVAL ( $ Package Package Package (x gtSR.txt C:\MYDOCU~1\RESEARCH\GTSR.TXT C:\MYDOCU~1\RESEARCH\GTSR.TXT w Subject: Serine Racemase mGenTHREADER Results
GenTHREADER PREDICTION RESULTS:
- Key -------------------------------------------------------------
Conf = Description of confidence level
Prob = Estimated probability of correct match
Epair = Pairwise energy for model
Esolv = Solvation energy for model
AlnSc = Sequence alignment score
Alen = Length of alignment
Dlen = Length of PDB entry
Tlen = Length of target sequence
PDB_ID = PDB identifier (+ chain code + domain code in CATH format)
-------------------------------------------------------------------
Confidence levels:
CERT > 99%
HIGH 99%
MEDIUM 90%
LOW 70%
MARG 40%
GUESS < 40%
-------------------------------------------------------------------
Conf Prob Epair Esolv AlnSc Alen DLen Tlen PDB_ID
=======================================================
CERT 1.000 -333.9 -2.1 741.0 307 315 339 1oasA0
CERT 1.000 -323.2 -8.3 675.0 324 331 339 1tdj01
CERT 1.000 -323.9 -6.8 673.0 330 510 339 1tdj00
CERT 1.000 -378.4 -2.1 655.0 324 395 339 2tysB0
MARG 0.422 -114.8 10.7 53.0 270 548 339 1mroA0
MARG 0.369 -126.2 -8.8 35.0 115 119 339 1srrA0
MARG 0.367 -93.1 1.1 45.0 164 168 339 1pjcA1
MARG 0.298 -133.3 4.0 39.0 180 184 339 1bg602
MARG 0.273 -43.2 8.6 46.0 203 209 339 1fsz01
MARG 0.271 -124.3 10.7 37.0 245 268 339 1mroA2
>>> Alignment with 1oasA0:
10 20 30 40
------------CCCCCCHHHHCCCCCEEECCCCC---CCCEEEEECCCCCCCCCHHHHH
1oasA0 ------------SKIYEDNSLTIGHTPLVRLNRIG---NGRILAKVESRNPSFSVKCRIG
| | || | | | | |
MCAQYCISFADVEKAHINIQDSIHLTPVLTSSILNQIAGRNLFFKCELFQKTGSFKIRGA
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
HHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHH
1oasA0 ANMIWDAEKRGVLKPGVELVEPTNGNTGIALAYVAAARGYKLTLTMPETMSIERRKLLKA
| | | || | || | | | | | |
LNAIRGLIPDTPEEKPKAVVTHSSGNHGQALTYAAKLEGIPAYIVVPQTAPNCKKLAIQA
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
CCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHCC
1oasA0 LGANLVLTEGAKGMKGAIQKAEEIVASDPQKYLLLQQFSNPANPEIHEKTTGPEIWEDTD
|| | | | |
YGASIVYCDPSDES--REKVTQRIMQETEGILV---HPNQEPAVIAGQGTIALEVLNQX-
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
CCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCCCC
1oasA0 GQVDVFISGVGTGGTLTGVTRYIKGTKGKTDLITVAVEPTDSPVIAQALAGEEIKPGPHK
|| | | || | | | |
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXAITIKALKPSVKVY--AAEPSNADDCYQSKLKGELTPNLHP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
CCCCCCCCCCC------CCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
1oasA0 IQGIGAGFIPG------NLDLKLIDKVVGITNEEAISTARRLMEEEGILAGISSGAAVAA
| | | | | | | | | | ||
PETIADGVKSSIGLNTWPIIRDLVDDVFTVTEDEIKYATQLVWGRMKLLIEPTAGVALAA
240 250 260 270 280 290
290 300 310
HHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHCCCCCCCCCC-----------
1oasA0 ALKLQEDESFTNKNIVVILPSSGERYLSTALFADLF-----------
| | | | | |
VLSQHFQTVSPEVKNVCIVLSGGNVDLTSLNWVGQAERPAPYQTVSV
300 LVAL ) 310 320 330
Percentage Identity = 18.1.
>>> Alignment with 1tdj01:
10 20 30 40 50
----CCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEECHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCC
1tdj01 ----QPLSGAPEGAEYLRAVLRAPVYEAAQVTPLQKMEKLSSRLDNVILVKREDRQPVHS
| | | || | | | | |
MCAQYCISFA----DVEKAHIN--IQDSIHLTPVLTSSILNQIAGRNLFFKCELFQKTGS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
CCHHHHHHHHHCCCC---CCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCHHH
1tdj01 FKLRGAYAMMAGLTE---EQKAHGVITASAGNHAQGVAFSSARLGVKALIVMPTATADIK
|| ||| || | | | | | ||| | | | || | |
FKIRGALNAIRGLIPDTPEEKPKAVVTHSSGNHGQALTYAAKLEGIPAYIVVPQTAPNCK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
HHHHHHHCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHC
1tdj01 VDAVRGFGGEVLLHGANFDEAKAKAIELSQQQGFTWVPPFDHPMVIAGQGTLALELLQQD
| | | | | | ||||||| ||| | |
KLAIQAYGASIVYCDPSDESREKVTQRIMQETEGILVHPNQEPAVIAGQGTIALEVLNQX
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
CCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCCCC-CC
1tdj01 AHLDRVFVPVGGGGLAAGVAVLIKQLMPQIKVIAVEAEDSACLKAALDAGHPVDLPR-VG
| || | | || | | |
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXAITIKALKPSVKVYAAEPSNADDCYQSKLKGELTPNLHPPE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
CCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH-
1tdj01 LFAEGVAVKRIGDETFRLCQEYLDDIITVDSDAICAAMKDLFEDVRAVAEPSGALALAG-
| || || | || || | | | || |||
TIADGVKS-SIGLNTWPIIRDLVDDVFTVTEDEIKYATQLVWGRMKLLIEPTAGVALAAV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
HHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH------
1tdj01 MKKYIALHNIRGERLAHILSGANVNFHGLRYVSERCELGE------
||| || | |
LSQHFQTVSPEVKNVCIVLSGGNVDLTSLNWVGQAERPAPYQTVSV
300 310 320 330
Percentage Identity = 25.7.
>>> Alignment with 1tdj00:
10 20 30 40 50
----CCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEECHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCC
1tdj00 ----QPLSGAPEGAEYLRAVLRAPVYEAAQVTPLQKMEKLSSRLDNVILVKREDRQPVHS
| | | || | | | | |
MCAQYCISFA----DVEKAHIN--IQDSIHLTPVLTSSILNQIAGRNLFFKCELFQKTGS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
CCHHHHHHHHHCCCC---CCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCHHH
1tdj00 FKLRGAYAMMAGLTE---EQKAHGVITASAGNHAQGVAFSSARLGVKALIVMPTATADIK
|| ||| || | | | | | ||| | | | || | |
FKIRGALNAIRGLIPDTPEEKPKAVVTHSSGNHGQALTYAAKLEGIPAYIVVPQTAPNCK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
HHHHHHHCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHC
1tdj00 VDAVRGFGGEVLLHGANFDEAKAKAIELSQQQGFTWVPPFDHPMVIAGQGTLALELLQQD
| | | | | | ||||||| ||| | |
KLAIQAYGASIVYCDPSDESREKVTQRIMQETEGILVHPNQEPAVIAGQGTIALEVLNQX
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
CCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCCCC-CC
1tdj00 LVAL * AHLDRVFVPVGGGGLAAGVAVLIKQLMPQIKVIAVEAEDSACLKAALDAGHPVDLPR-VG
| || | | || | | |
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXAITIKALKPSVKVYAAEPSNADDCYQSKLKGELTPNLHPPE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
CCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH-
1tdj00 LFAEGVAVKRIGDETFRLCQEYLDDIITVDSDAICAAMKDLFEDVRAVAEPSGALALAG-
| || || | || || | | | || |||
TIADGVKS-SIGLNTWPIIRDLVDDVFTVTEDEIKYATQLVWGRMKLLIEPTAGVALAAV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
HHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCCHHH
1tdj00 MKKYIALHNIRGERLAHILSGANVNFHGLRYVSERCELGEQREALLAVTIPEEKGSFLKF
||| || | |
LSQHFQTVSPEVKNVCIVLSGGNVDLTSLNWVGQAERPAPYQTVSV--------------
300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
HHCCCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCHHH
1tdj00 CQLLGGRSVTEFNYRFADAKNACIFVGVRLSRGLEERKEILQMLNDGGYSVVDLSDDEMA
------------------------------------------------------------
420 430 440 450 460 470
HHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCCCCE
1tdj00 KLHVRYMVGGRPSHPLQERLYSFEFPESPGALLRFLNTLGTYWNISLFHYRSHGTDYGRV
------------------------------------------------------------
480 490 500 510
EEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHCCC
1tdj00 LAAFE----------------YDCHDETNNPAFRFFLAG
---------------------------------------
Percentage Identity = 25.1.
>>> Alignment with 2tysB0:
10 20 30 40 50 60
CCCCCEECCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEC
2tysB0 TLLNPYFGEFGGMYVPQILMPALNQLEEAFVRAQKDPEFQAQFADLLKNYAGRPTALTKC
|
---------------------------MCAQYCISFADVEKAHINI-QDSIHL-TPVLTS
10 20 30
70 80 90 100 110
CCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHH---HHHHHHHHCCCCEEEEEECCCHHHHHH
2tysB0 QNITAGTRTTLYLKREDLLHGGAHTTNQVL---GQALLAKRMGKSEIIAETGAGQHGVAS
| | | | | | | || |
SILNQIAGRNLFFKCELFQKTGSFKIRGALNAIRGLIPDTPEEKPKAVVTHSSGNHGQAL
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
HHHHHHHCCEEEEEEEHHHHHHCHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
2tysB0 ALASALLGLKCRIYMGAKDVERQSPNVFRMRLMGAEVIPVHSGSATLKDACNEALRDWSG
| | | | || |
TYAAKLEGIPAYIVVPQTAPNC---KKLAIQAYGASIVYCDPSDESREKVTQRIMQETEG
100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
HCCCEEECCCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHH
2tysB0 SYETAHYMLGTAAGPHPYPTIVREFQRMIGEETKAQILDKEGRLPDAVIACVGGGSNAIG
| | | | |
IL-----------VHPNQEPAVIAGQGTIALEVLNQX-----XXXXXXXXXXXXXXXXXX
160 170 180 190
240 LVAL + 250 260 270 280 290
HHHHHCC-CCCCEEEEEEEEECCC----CCCCCCCHHHHCEEEEECEEEEEECCCCCCCC
2tysB0 MFADFIN-DTSVGLIGVEPGGHGI----ETGEHGAPLKHGRVGIYFGMKAPMMQTADGQI
|| || | | | | |
XAITIKALKPSVKVYAAEPSNADDCYQSKLKGELTPNLHPPETIADGVK-----------
200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
2tysB0 EESYSISAGLDFPSVGPQHAYLNSIGRADYVSITDDEALEAFKTLCRHEGIIPALESSHA
| | | | || | |
------------SSIGLNTWPIIRDLVDDVFTVTEDEIKYATQLVWGRMKLLIEPTAGVA
250 260 270 280
360 370 380 390
HHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCC-------
2tysB0 LAHALKMMREQPEKEQLLVVNLSGRGDKDIFTVHDILKARGEI-------
|| | | | | | |
LAAVLSQHFQTVSPEVKNVCIVLSGGNVDLTSLNWVGQAERPAPYQTVSV
300 310 320 330
Percentage Identity = 14.2.
>>> Alignment with 1mroA0:
-------------------------------------------------------CCCCC
1mroA0 -------------------------------------------------------ADKLF
MCAQYCISFADVEKAHINIQDSIHLTPVLTSSILNQIAGRNLFFKCELFQKTGSFKIRGA
10 20 30 40 50 60
10 20 30 40 50 60
HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCC
1mroA0 INALKKKFEESPEEKKTTFYTLGGWKQSERKTEFVNAGKEVAAKRGIPQYNPDIGTPLGQ
|| |||| | | ||| | |
LNAIRGLIPDTPEEKPKAVVTH----SSGNHGQALTYAAKL---EGIPAYIVVPQTAPNC
70 80 90 100 110
70 80 90 100 110
CCCCEEECCCCCCEEEHHH--HCCCCCHHHHH-----HHHHHHCEEEEECHH-HHHHHHH
1mroA0 RVLMPYQVSTTDTYVEGDD--LHFVNNAAMQQ-----MWDDIRRTVIVGLNH-AHAVIEK
| | | | || || | | |
KKLAIQAYGASIVYCDPSDESREKVTQRIMQETEGILVHPNQEPAVIAGQGTIALEVLNQ
120 130 140 150 160 170
120 130 140 150 160 170
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC-CCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHCC
1mroA0 RLGKEVTPETITHYLETVNHAMPGAAVVQEHMV-ETHPALVADSYVKVFTGNDEIADEID
| | | | | | |
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAITIKALKPSVKVYAAEPSNADDCY------QSKLKGELT
180 190 200 210 220
180 190 200 210 220 230
CCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEE-----CCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
1mroA0 PAFVIDINKQFPEDQAETLKAEVGDGIWQVVR-----IPTIVSRTCDGATTSRWSAMQIG
| | || | | | | | | || | |
P------NLHPPETIADGVKSSIGLNTWPIIRDLVDDVFTVTEDEIKYATQLVWGRMKLL
230 240 250 260 270 280
240 250 260 270 280 290
HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCH
1mroA0 MSMISAYKQAAGEAATGDFAYAAK-AEVIHMGTYLPVR-ARGENEPGGVPFGYLADICQS
|| || | | | | |
IEPTAGVAL----AAVLSQHFQTVSPEVKNVCIVLSG---------GNVDLTSLNWVGQA
290 300 310 320
300 310 320 330 340 350
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
1mroA0 SRVNYEDPVRVSLDVVATGAMLYDQIWLGSYMSGGVGFTQYATAAYTDNILDDFTYFGKE
| | | LVAL ,
ERPAPYQTVSV-------------------------------------------------
360 370 380 390 400 410
HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCHHCHHHHHHHHHHHH
1mroA0 YVEDKYGLCEAPNNMDTVLDVATEVTFYGLEQYEEYPALLEDQFGGS-RAAVVAAAAGCS
------------------------------------------------------------
420 430 440 450 460 470
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCC
1mroA0 TAFATGNAQTGLSGWYLSMYLHKEQHSRLGFY-YDLQDQ-GASNVFSIRGDEGLPLELRG
------------------------------------------------------------
480 490 500 510 520 530
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHH
1mroA0 PNYPNYAMNVGHQGEYAGISQAPHAARGDAFVFNPLVKIAFADDNLVFDFTNVRGEFAKG
------------------------------------------------------------
540
HCCCCCCCCCCCCCCCC
1mroA0 ALREFEPAGERALITPA
-----------------
Percentage Identity = 16.8.
>>> Alignment with 1srrA0:
------------------------------------------------------------
1srrA0 ------------------------------------------------------------
MCAQYCISFADVEKAHINIQDSIHLTPVLTSSILNQIAGRNLFFKCELFQKTGSFKIRGA
10 20 30 40 50 60
------------------------------------------------------------
1srrA0 ------------------------------------------------------------
LNAIRGLIPDTPEEKPKAVVTHSSGNHGQALTYAAKLEGIPAYIVVPQTAPNCKKLAIQA
70 80 90 100 110 120
10 20 30 40 50
-CCEEEEECCCHHHHHHHHHHH--HCCCCEE-------EEECCHHHHHHHHHHHCCCEEE
1srrA0 -NEKILIVDDQSGIRILLNEVF--NKEGYQT-------FQAANGLQALDIVTKERPDLVL
| | | || | | ||
YGASIVYCDPSDESREKVTQRIMQETEGILVHPNQEPAVIAGQGTIALEVLNQXXXXXXX
130 140 150 160 170 180
60 70 80 90 100
EECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCH-HHH
1srrA0 LDMKIPGMDGIEILKRMKVIDENIRVIIMTAYGELDMIQESKELGALTHFAKPFDI-DEI
| | | |
XXXXXXXXXXXXXAITIKALKPSVKVYA----AEPSNADDCYQSKLKGELTPNLHPPETI
190 200 210 220 230
HHHHHHHCCC--------------------------------------------------
1srrA0 RDAVKKYLPL--------------------------------------------------
| || |
ADGVKSSIGLNTWPIIRDLVDDVFTVTEDEIKYATQLVWGRMKLLIEPTAGVALAAVLSQ
240 250 260 270 280 290
-------------------------------------------
1srrA0 -------------------------------------------
HFQTVSPEVKN LVAL - VCIVLSGGNVDLTSLNWVGQAERPAPYQTVSV
300 310 320 330
Percentage Identity = 14.3.
>>> Alignment with 1pjcA1:
10
-------------------------------------------HHHHHHHHHHHHCCCCC
1pjcA1 -------------------------------------------AGRLSVQFGARFLERQQ
| | |
MCAQYCISFADVEKAHINIQDSIHLTPVLTSSILNQIAGRNLFFKCELFQKTGSFKIRGA
10 20 30 40 50 60
20 30 40 50 60 70
CCC-CCCCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEE------CCHHHHHH
1pjcA1 GGR-GVLLGGVPGVKPGKVVILGGGVVGTEAAKMAVGLGAQVQIFD------INVERLSY
| | || || | | | | |
LNAIRGLIPDTPEEKPKAVVTHSSGNHGQALTYAAKLEGIPAYIVVPQTAPNCKKLAI--
70 80 90 100 110
80 90 100 110 120
HHHHHHHHCEEEECCHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCH------HHHCCCCC
1pjcA1 LETLFGSRVELLYSNSAEIETAVAEADLLIGAVLVPGRRAPILVPA------SLVEQMRT
| | || | |
--QAYGASIVYCDPSDESREKVTQRIMQETEGILVHPNQEPAVIAGQGTIALEVLNQXXX
120 130 140 150 160 170
130 140 150 160
CCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCEEEECCCCHHHH----------------
1pjcA1 GSVIVDVAVDQGGCVETLHPTSHTQPTYEVFGVVHYGVPNMPGA----------------
| |
XXXXXXXXXXXXXXXXXAITIKALKPSVKVYAAEPSNADDCYQSKLKGELTPNLHPPETI
180 190 200 210 220 230
------------------------------------------------------------
1pjcA1 ------------------------------------------------------------
ADGVKSSIGLNTWPIIRDLVDDVFTVTEDEIKYATQLVWGRMKLLIEPTAGVALAAVLSQ
240 250 260 270 280 290
-------------------------------------------
1pjcA1 -------------------------------------------
HFQTVSPEVKNVCIVLSGGNVDLTSLNWVGQAERPAPYQTVSV
300 310 320 330
Percentage Identity = 13.1.
>>> Alignment with 1bg602:
------------------------------------------------------------
1bg602 ------------------------------------------------------------
MCAQYCISFADVEKAHINIQDSIHLTPVLTSSILNQIAGRNLFFKCELFQKTGSFKIRGA
10 20 30 40 50 60
10 20 30 40
---------------CCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCC---HHHHHHHHH
1bg602 ---------------SKTYAVLGLGNGGHAFAAYLALKGQSVLAWDID---AQRIKEIQD
| || | | | | ||
LNAIRGLIPDTPEEKPKAVVTHSSGNHGQALTYAAKLEGIPAYIVVPQTAPNCKKLAIQA
70 80 90 100 110 120
50 60 70 80 90 100
HCC-EEEECCCCCEE-ECCCEEECCHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
1bg602 RGA-IIAEGPGLAGT-AHPDLLTSDIGLAVKDADVILIVVPAIHHASIAANIASYISEGQ
|| | | ||
YGASIVYCDPSDESREKVTQRIMQETEGILVHPNQE--PAVIAGQGTIALEVLNQXXXXX
130 140 150 160 170
110 120 130 140 150
EEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEE-- LVAL . -EECCCCEEEECCCCCEEEEEEECCCEE
1bg602 LIILNPGATGGALEFRKILRENGAPEVTIG---ETSSMLFTCRSERPGQVTVNAIKGAMD
|
XXXXXXXXXXXXXXXAITIKALKPSVKVYAAEPSNADDCYQSKLKGELTPNLHPPETIAD
190 200 210 220 230
160 170 180
EEEECHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECC---------------------------------
1bg602 FACLPAAKAGWALEQIGSVLPQYVAVE---------------------------------
| |
GVKSSIGLNTWPIIRDLVD--DVFTVTEDEIKYATQLVWGRMKLLIEPTAGVALAAVLSQ
250 260 270 280 290
-------------------------------------------
1bg602 -------------------------------------------
HFQTVSPEVKNVCIVLSGGNVDLTSLNWVGQAERPAPYQTVSV
300 310 320 330
Percentage Identity = 9.8.
>>> Alignment with 1fsz01:
------------------------------------------------------------
1fsz01 ------------------------------------------------------------
MCAQYCISFADVEKAHINIQDSIHLTPVLTSSILNQIAGRNLFFKCELFQKTGSFKIRGA
10 20 30 40 50 60
10 20 30 40 50
-CHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCHHHHHCCCC
1fsz01 -SPEDKELLEYLQQTKAKITVVGCGGAGNNTITRLKMEGIEGAKTVAINTDAQQLIRTKA
| | | ||| | |
LNAIRGLIPDTPEEKPKAVVTHSSGNHGQALTYAAKLEGIPAYIVVPQTAPNCKKLAIQA
70 80 90 100 110 120
60 70 80 90 100
----------------CEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCEE
1fsz01 ----------------DKKILIGKKLTRGLGAGGNPKIGEEAAKESAEEIKAAIQDSDMV
| | | |
YGASIVYCDPSDESREKVTQRIMQETEGILVHPNQEPAVIAGQGTIALEVLNQXXXXXXX
130 140 150 160 170 180
110 120 130 140 150 160
EEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
1fsz01 FITCGLGGGTGTGSAPVVAEISKKIGALTVAVVTLPFVMEGKVRMKNAMEGLERLKQHTD
| | |
XXXXX-XXXXXXXXAITIKALKPSVKVYAAEPSNAD-DCYQSKLKGELTPNLHPPETIAD
190 200 210 220 230
170 180 190 200
EEEEEEHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC--------------
1fsz01 TLVVIPNEKLFEIVPNMPLKLAFKVADEVLINAVKGLVELITKDGL--------------
| | | | |
GVKSSIGLNTWPIIRDLV-DDVFTVTEDEIKYATQ---LVWGRMKLLIEPTAGVALAAVL
250 260 270 280 290
---------------------------------------------
1fsz01 ---------------------------------------------
SQHFQTVSPEVKNVCIVLSGGNVDLTSLNWVGQAERPAPYQTVSV
300 310 320 330
Percentage Identity = 9.6.
>>> Alignment with 1mroA2:
-------------------------------------------------------CCCCC
1mroA2 -------------------------------------------------------ADKLF
MCAQYCISFADVEKAHINIQDSIHLTPVLTSSILNQIAGRNLFFKCELFQKTGSFKIRGA
10 20 30 40 LVAL / 50 60
10 20 30 40 50 60
HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCC
1mroA2 INALKKKFEESPEEKKTTFYTLGGWKQSERKTEFVNAGKEVAAKRGIPQYNPDIGTPLGQ
|| |||| | | ||| | |
LNAIRGLIPDTPEEKPKAVVTH----SSGNHGQALTYAAKL---EGIPAYIVVPQTAPNC
70 80 90 100 110
70 80 90 100 110
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1mroA2 RVLMPYQVSTTDTYVEGDD--LHFVNNAAMQQ-----MWDDIRRTVIVGLNH-AHAVIEK
| | | | || || | | |
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120 130 140 150 160 170
120 130 140 150 160 170
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC-CCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHCC
1mroA2 RLGKEVTPETITHYLETVNHAMPGAAVVQEHMV-ETHPALVADSYVKVFTGNDEIADEID
| | | | | | |
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAITIKALKPSVKVYAAEPSNADDCY------QSKLKGELT
180 190 200 210 220
180 190 200 210 220 230
CCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHCCC-----CHHHHHHHHHHH
1mroA2 PAFVIDINKQFPEDQAETLKAEVGDGIWQVVRIPTIVSRTCDG-----ATTSRWSAMQIG
| | || | | | | | | || | |
P------NLHPPETIADGVKSSIGLNTWPIIRDLVDDVFTVTEDEIKYATQLVWGRMKLL
230 240 250 260 270 280
240 250 260
HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCCC-----------------------
1mroA2 MSMISAYKQAAGEAATGDFAYAAK-AEVIHMGTYLPV-----------------------
|| || |
IEPTAGVAL----AAVLSQHFQTVSPEVKNVCIVLSGGNVDLTSLNWVGQAERPAPYQTV
290 300 310 320 330
--
1mroA2 --
SV
Percentage Identity = 18.7. ,EVPh j hpih $CK
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! gtSR.txt! Courier New - B LVAL N ʾ T a b l e 1 Q u e r y 1
f ^ 3 LVAL 2 $ Package Package Package blast_SRmouse2.htm C:\MYDOCU~1\RESEARCH\BLAST_~4.HTM " C:\MYDOCU~1\RESEARCH\BLAST_~4.HTM
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PBIL in Lyon, France
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Database of 1101 domains
Matrix: gonnet
Secondary structure prediction:
Contact Capacity Potentials
Penalty for Gap opening: -10.000000
Penalty for Gap extension: -1.000000
Q_Seq: PerlScript 339 a.a. Protein
20 best hits:
PDB ID raw score Z-score a.a. aligned % identities SCOP family d1tdj_1 331 a.a. 8330 24.74 322 28 3.73.1.1.3 d1oasa_ 315 a.a. 7784 23.05 306 21 3.73.1.1.2 d2tysb_ 397 a.a. 6431 18.86 327 16 3.73.1.1.1 d1qg6a_ 257 a.a. 1639 4.03 234 10 3.2.1.2.17 d1ybva_ 283 a.a. 1560 3.79 264 11 3.2.1.2.20 d1cyda_ 244 a.a. 1512 3.64 225 14 3.2.1.2.6 d1eny__ 268 a.a. 1485 3.56 233 10 3.2.1.2.16 d1hdca_ 253 a.a. 1435 3.40 231 10 3.2.1.2.12 d1bdb__ 276 a.a. 1403 3.30 255 10 3.2.1.2.13 d1fmca_ 255 a.a. 1375 3.22 225 16 3.2.1.2.11 d2ae2a_ 260 a.a. 1343 3.12 216 14 3.2.1.2.19 d1dhpa_ 292 a.a. 1329 3.08 266 8 3.1.9.1.2 d1fds__ 287 a.a. 1328 3.07 258 13 3.2.1.2.10 d1hdr__ 244 a.a. 1323 3.06 236 11 3.2.1.2.9 d1bgva1 255 a.a. 1314 3.03 239 11 3.2.1.7.1 d1b16a_ 254 a.a. 1306 3.00 236 13 3.2.1.2.14 d1eno__ 308 a.a. 1284 2.94 256 8 3.2.1.2.15 d1brwa2 260 a.a. 1245 2.82 246 9 3.20.1.1.2 d1d0va_ 349 a.a. 1237 2.79 321 10 3.33.1.1.1 d1qr6a1 294 a.a. 1234 2.78 256 8 3.2.1.7.10 Alignments: seq d1tdj_1 8330 348 0.00 -100000.00 330 8 s_m = 8454 s_ss = 134 s_cc = 354 go = -500 ge = -140 HHHHH HHHHHHHH H EEE E E HHHHHHH HE HE E HHHH EE H MCAQYCISFADVEK--AHINIQDSIHLTPVLTSSILNQIAGRNLFFKCELFQKTGSFKIR : || *|| : ||::|||.||.**|..|::*|| .|.:|||*|*|:*|||***|* QPLSGAPEGAEYLRAVLRAPVYEAAQVTPLQKMEKLSSRLDNVILVKREDRQPVHSFKLR TTTT HHHHHHHHHHTTGGG EEE HHHHHH EEEEETTTTTTTTT HHH HHHHHH EEEEEEE HHHHHHHHHHH EEEEE HHHHH GALNAIRGLIPDTPEEK-PKAVVTHSSGNHGQALTYAAKLEGIPAYIVVPQTAPNCKKLA **:|||:** .|| ::*|*|*|***|*|||:|||..*||*|**|*..||| *..* GAYAMMAGLTEEQ----KAHGVITASAGNHAQGVAFSSARLGVKALIVMPTATADIKVDA HHHHHHHHTTTTT TTTTTEEEE HHHHHHHHHHHHH EEEE TTTT HHHHHH HH EEEEEE H HHHHHHHHHHHH EEE EEEEHE EEHHHHHHH IQAYGASIVYCDPSDESREKVTQRIMQETEGILVHPNQEPAVIAGQGTIALEVLNQVPLV ||||*||||:|::|.|. .|||:||:*|:||:|*|*|||*|*******|***|*|*::.| VRGFGGEVLLHGANFDEAKAKAIELSQQQGFTWVPPF LVAL R DHPMVIAGQGTLALELLQQDAHL HHHH EEE TTTHHHHHHHHHHHHHHH EE TTTT HHHHHHHHHHHHHHHHHTTTT EEEEE EEEHHHEEHHH EEEEEE HHHH H E E DALVVPVGGGGMVAGIAITIKALKPSVKVYAAEPSNADDCYQSKLKGELTPNLHPPETIA *:||*******||**|*::**.*.*||**|*|*|.||| ||:|: :*| :.: ..|.||* DRVFVPVGGGGLAAGVAVLIKQLMPQIKVIAVEAEDSACLKAALDAGHPVDL-PRVGLFA EEEEETTTTHHHHHHHHHHHHHTTTTEEEEEEETTTTHHHHHHHH T TTT TTT EHH E EE HHHHHHHHHHH HHHHHE HHHHHHHHHHH DGV-KSSIGLNTWPIIRDLVDDVFTVTEDEIKYATQLVWGRMKLLIEPTAGVALAAVLSQ |** |.**|.*|| |.:||**||**||*:* :*|||||: .||||**||||***||||. 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HHHHHTTGGGTTT EEEEE T GGGTTTTGGGTTT seq d2tysb_ 6431 409 0.00 -100000.00 364 45 s_m = 7938 s_ss = 9 s_cc = 282 go = -1100 ge = -740 HHHHH HHHHHH HHH EEE E E ---------------------------MCAQYCISFADV---EKAHINIQDSIHL-TPVL |:..| .* :::| |:|:||| *||| MTTLLNPYFGEFGGMYVPQILMPALNQLEEAFVRAQKDPEFQAQFADLLKNYAGRPTALT UU EETTEE GGGHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHTTTT EE HHHHHHH HE HE E HHHH EE HHHHHHH EEEEEEE HH TSSILNQIAGRNLFFKCELFQKTGSFKIRGALNAIRGLIPDTPEEKPKAVVTHSSGNHGQ :||:||| .|:|*||*.*|:|||*|||||||*:||:.| : |. ::|||||||*|**| KCQNITAGTRTTLYLKREDLLHGGAHTTNQVLGQALLAKRMGK---SEIIAETGAGQHGV ETTTTTTTT EEEEEEEGGGTTTTTHHHHHHHHHHHHHHHH EEEEEETTTHHHH HHHHHHHHH EEEEE HHHHH HH EEEEEE H HHHHHHHHHHHH ALTYAAKLEGIPAYIVVPQTAPNCKKLA---IQAYGASIVYCDPSDESREKVTQRIMQET *|||*||*.*||||*||| ||:. ::| |::|**:||:||:|. : . |||:|:||. 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NPS@ is the IBCP contribution to PBIL in Lyon, France
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: Bacillus subtilis protein sequence databank added (see news)
Consensus prediction result for : UNK_9791210
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10 20 30 40 50 60 70 | | | | | | | UNK_9791210 MCAQYCISFADVEKAHINIQDSIHLTPVLTSSILNQIAGRNLFFKCELFQKTGSFKIRGALNAIRGLIPD DPM ccheeeeeehcehhhcececcceceeceeeeceeccectcceeehehhectctceceechhcheeccccc DSC cccccccchhhhhhhhhhhhhhccccccchhhhhhhhccceeeeeeccccccceeeeecchhhhhhhhhc GOR4 ccccccccccccchhhhccccccccccccchhhhhhhhhhchhhheeeeccccchhhhhhhhhhhccccc HNNC ccceeeeeehhhhhhhhhhhhcccccchhhhhhhhhhccchheeeehhhccccchhehhhhhhhhhcccc PHD ccceeeeechhhhhhhhhhhhhccccccccchhhhhhccceeeeeecccccccccccchhhhhhhhhhhh Predator ccceeeeeecccccccccccccceeeccchhhhhhhhcccceeecccccccccccchhhhhhhhhhcccc SIMPA96 cccceeeccccccccccccccccccchhhhhhhhhhhcccceeeeeeeeccccchhhhhhhhhhhhcccc SOPM hhhhheeehhhhhhtccccccccccchhhhhhhhhhhttcceeeehhhhhcccccchhhhhhhhhtcccc Sec.Cons. ccceeeee?h?hhhh?hcccccccccccchhhhhhhhcccceeeee???ccccc?chhhhhhhhhhcccc 80 90 100 110 120 130 140 | | | | | | | UNK_9791210 TPEEKPKAVVTHSSGNHGQALTYAAKLEGIPAYIVVPQTAPNCKKLAIQAYGASIVYCDPSDESREKVTQ DPM ccccccceeeecctttccccccchhhhccccceeeecccccctcchhehhccceeeeccccccthhheee DSC ccccceeeeccccccccchhhhhhhhhhccceeeecccccchhhhhhhhcccceeeecccccccchhhhh GOR4 ccccccceeeeeccccchhhhhhhhhhccccceeeecccccccchhhhccccceeeeccccccchhhhhh HNNC ccccccceeeeeccccchhhhhhhhhhcccceeeeecccccchhheeehcccceeeeecccccchhhhhh PHD ccccceeeeeeccchhhhhhhhhhhhhhccceeeeecccccccchhheeccceeeeeecccchhhhhhhh Predator cccccceeeeeecccccchhhhhhhhhccccceeeeeccccchhhhhhhhccceeeecccccchhhhhhh SIMPA96 cccccceeeeeccccccchhhhhhhhccccceeeeccccccchhhhhhhhccceeeeccccchhhhhhhh SOPM ccccccceeeeecccctthhhhhhhhhttcceeeeecccccccceeeeehttceeeeecccccchhhhhh Sec.Cons. cccccc?eeee?cccccchhhhhhhhhcccceeeeecccccch?hhh?h?ccceeeeccccccchhhhhh 150 160 170 180 190 200 210 | | | | | | | UNK_9791210 RIMQETEGILVHPNQEPAVIAGQGTIALEVLNQVPLVDALVVPVGGGGMVAGIAITIKALKPSVKVYAAE DPM eeehhccceeeccccccheectccceeeheeceeceeceeeecettccceeeeeeeeehctcceeeehht LVAL o DSC hhhhhccceeecccccccccccccccchhhhhhhcccceeeeecccccceeeeeeecccccccceeeeec GOR4 hhhhhhcceeecccccceeecccchhhhhhhccccccceeeeccccccchhhhhhhhhhccccceeeeec HNNC hhhhhccceeecccccceeeecccceeeehhcccccceeeeeecccchhhhhhhehhhhcccceeeeeec PHD hhhhcccceeeeccccccccccccchhhhhhhhhhccceeeeeccchhhhhhhhhhhhhhcccceeeeee Predator hhhhhhhheeecccccceeeeccchhhhhhhhceeeceeeeeecccceeehhhhhhhhhcccceeeeeec SIMPA96 hhhhhccceeecccccceeecccchhhhhhhccccccceeeeecccccchhhhhhhhhhccccceeeecc SOPM hhhhttteeeecttccceeeetccceehhhhttcccceeeeeeetttceeeeeeeehhhccttceeeecc Sec.Cons. hhhhhccceeecccccceeeccccchhhhhhccccccceeeeecccccc?hhhh?hhhhccccceeeeec 220 230 240 250 260 270 280 | | | | | | | UNK_9791210 PSNADDCYQSKLKGELTPNLHPPETIADGVKSSIGLNTWPIIRDLVDDVFTVTEDEIKYATQLVWGRMKL DPM cctcccccccctcccccccccccccccccecceecccccceeeeeeceeeeeehcheccceeeeecehhe DSC cccccccchhcccccccccccccccccccccccccccchhhhhhhhhhheeecchhhhhhhhhhhcceee GOR4 cccccchhhhccccccccccccccceeccceeeccccccceeecccccceeechhhhhhhhhhhhhhhhe HNNC ccccccchhhcccccccccccccccchhchhcceccccchhhhhhhhhhhhhchhhhhhhhhhhhcccee PHD ccchhhhhhhhhcccccccccccccccccccccchhhhhhhhhhhccceeeeecchhhhhhhhhhhhccc Predator cccccchhhhhhhcccccccccccccccccccccccccccccccccccceeechhhhhhhhhhhhhhhhh SIMPA96 ccccchhhhhhcccccccccccchhhhhcccccccccchhhhhhhhhhheeehhhhhhhhhhhhhcccee SOPM ccccchhhhhhhccccccccccccchhhhhhhhccccccchhhhhhhhheeechhhhhhhhhhhhhhhee Sec.Cons. cccccchhhh?cccccccccccccccccccccccccccc?hhhhhh?hheeechhhhhhhhhhhh?hhee 290 300 310 320 330 | | | | | UNK_9791210 LIEPTAGVALAAVLSQHFQTVSPEVKNVCIVLSGGNVDLTSLNWVGQAERPAPYQTVSV DPM eecccccehhhheeeeceeeeccceceeeeeettctececceceec< LVAL q /FONT>hhhcccccceecc DSC eeccccchhhhhhhhhhhhhccccccceeeeeccccccchhhhhhhhhccccccccccc GOR4 eecchhhhhhhhhhhhhcceeccccceeeeeeccccceeeeeccccccccccceeeeec HNNC eecccchhhhhhhhhhhhhhcccccceeeeeecccccceeceeeccccccccccccccc PHD eeccchhhhhhhhhhhhhccccccccceeeeeeccchhhhhhhhhhhhhcccccceeec Predator hccccchhhhhhhhhhhhccccccccceeeeeccccccccccccccccccccccccccc SIMPA96 eecccchhhhhhhhhhhhccccccccceeeeeccccceeeeeeeccccccccccceeec SOPM eecttchhhhhhhhhhhhhhccttcceeeeeettccceeeeeehhcccccccccceeee Sec.Cons. eecccchhhhhhhhhhhhc?cccccc?eeeeeccccccee?e??cccccccccccee?c Sequence length : 339DPM : Alpha helix (Hh) : 40 is 11.80% 310 helix (Gg) : 0 is 0.00% Pi helix (Ii) : 0 is 0.00% Beta bridge (Bb) : 0 is 0.00% Extended strand (Ee) : 128 is 37.76% Beta turn (Tt) : 18 is 5.31% Bend region (Ss) : 0 is 0.00% Random coil (Cc) : 153 is 45.13% Ambigous states (?) : 0 is 0.00% Other states : 0 is 0.00%DSC : Alpha helix (Hh) : 112 is 33.04% 310 helix (Gg) : 0 is 0.00% Pi helix (Ii) : 0 is 0.00% Beta bridge (Bb) : 0 is 0.00% Extended strand (Ee) : 56 is 16.52% Beta turn (Tt) : 0 is 0.00% Bend region (Ss) : 0 LVAL r is 0.00% Random coil (Cc) : 171 is 50.44% Ambigous states (?) : 0 is 0.00% Other states : 0 is 0.00%GOR4 : Alpha helix (Hh) : 105 is 30.97% 310 helix (Gg) : 0 is 0.00% Pi helix (Ii) : 0 is 0.00% Beta bridge (Bb) : 0 is 0.00% Extended strand (Ee) : 64 is 18.88% Beta turn (Tt) : 0 is 0.00% Bend region (Ss) : 0 is 0.00% Random coil (Cc) : 170 is 50.15% Ambigous states (?) : 0 is 0.00% Other states : 0 is 0.00%HNNC : Alpha helix (Hh) : 122 is 35.99% 310 helix (Gg) : 0 is 0.00% Pi helix (Ii) : 0 is 0.00% Beta bridge (Bb) : 0 is 0.00% Extended strand (Ee) : 69 is 20.35% Beta turn (Tt) : 0 is 0.00% Bend region (Ss) : 0 is 0.00% Random coil (Cc) : 148 is 43.66% Ambigous states (?) : 0 is 0.00% Other states : 0 is 0.00%PHD : Alpha helix (Hh) : 142 is 41.89% 310 helix (Gg) : 0 is 0.00% Pi helix (Ii) : 0 is 0.00% Beta bridge (Bb) : 0 is 0.00% Extended strand (Ee) : 61 is 17.99% Beta turn (Tt) : 0 is 0.00% Bend region (Ss) : 0 is 0.00% Random coil (Cc) : 136 is 40.12% Ambigous states (?) : 0 is 0.00% Other states : 0 is 0.00%Predator : Alpha helix (Hh) : 104 is 30.68% 310 helix (Gg) : 0 is 0.00% Pi helix (Ii) : 0 is 0.00% Beta bridge (Bb) : 0 is 0.00% Extended strand (Ee) : 60 is 17.70% Beta turn (Tt) : 0 is 0.00% Bend region (Ss) : 0 is 0.00% Random coil (Cc) : 175 is 51.62% Ambigous states (?) : 0 is 0.00% Other states : 0 is 0.00%SIMPA96 : Alpha helix (Hh) : 116 is 34.22% 310 helix (Gg) : 0 is 0.00% Pi helix (Ii) : 0 is 0.00% Beta bridge (Bb) : 0 is 0.00% Extended strand (Ee) : 61 is 17.99% Beta turn (Tt) : 0 is 0.00% Bend region (Ss) : 0 is 0.00% Random coil (Cc) : 162 is 47.79% Ambigous states (?) : 0 is 0.00% Other states : 0 is 0.00%SOPM : Alpha helix (Hh) : 118 is 34.81% 310 helix (Gg) : 0 is 0.00% Pi helix (Ii) : 0 is 0.00% Beta bridge (Bb) : 0 is 0.00% Extended strand (Ee) : 79 is 23.30% Beta turn (Tt) : 29 is 8.55% Bend region (Ss) : 0 is 0.00% Random coil (Cc) : 113 is 33.33% LVAL s Ambigous states (?) : 0 is 0.00% Other states : 0 is 0.00%Sec.Cons. : Alpha helix (Hh) : 101 is 29.79% 310 helix (Gg) : 0 is 0.00% Pi helix (Ii) : 0 is 0.00% Beta bridge (Bb) : 0 is 0.00% Extended strand (Ee) : 56 is 16.52% Beta turn (Tt) : 0 is 0.00% Bend region (Ss) : 0 is 0.00% Random coil (Cc) : 158 is 46.61% Ambigous states (?) : 24 is 7.08% Other states : 0 is 0.00%
SOPM parameters : Window width : 17 Similarity threshold : 8 Number of states : 4View prediction result file in MPSA : [DPM] [DSC] [GOR4] [HNN] [PHD] [PREDA] [SIMPA96] [SOPM]
View prediction result file in ANTHEPROT : [DPM] [DSC] [GOR4] [HNN] [PHD] [PREDA] [SIMPA96] [SOPM]
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Comments. Last modified: Sat Jun 17 08:20:22 2000. Current time: Sat Jun 17 08:20:22 2000 > > n> `> T> METAFILEPICT @ E ! 2 MS Sans Serif - e A > ( ? ! A F f > ( pppPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP pppPPP pppPPP pppPPP pppPPP 000000PPP 00 ppp00 00` ` ` ` PPP 00 00`0` `0`0`0`0` ` PPP ppp00 `000000LVAL `0`0`0`0`0`0`0`0`0` PPP ___`00 `00 00`0`0`0` ` ` `0`0`0`0`0` PPP ___ `00000`0` `0` 00`0`0`0ϟ `0` PPP ___``00000`0`0` `0ϟ ϟ ` PPP ppp` `000`0`0` PPP ppp````0` `0` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` PPP pppϐ` `0`0`0`0`0`0ϟ0ϟ0ϟ0 ` PPP 00``0`0` ` ` ` ` ` ` ` ` ` PPP 00``0` ` ` ` ` PPP 0000``0` ` ` ϟ0`` PPP 00` ϟ`` ` 000000` ϟ0 ` ` PPP 00` ` ϟ`0`0`0`0ϟ0 ϟ0 ` PPP 00` `0`0`0`0`0`0ϟ0 ` `0PPP ppp` ` ` ` ` ` ` ` ` PPP ppp` ` ` ` PPP ppp` ` ` ` pppPPP pppPPP000000000000000000 pppϟPPP pppϟPPP pppϟPPP pppPPP pppPPP ppp . ! Consensus_SRmouse.htm ! 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